网页时效性：互联网上的用户众多，数据信息来源极广，互联网上的网页是呈实时动态变化的，网页的更新、删除等变动极为频繁，有时候会出现新更新的网页在爬虫程序还来不及抓取的时候却已经被删除的情况，这将大大影响搜索结果的准确性。  

大数据存储问题：爬虫抓取的数据在经过预处理后数据量依然相当庞大，这给大数据存储技术带来相当大的挑战。当前大部分搜索引擎都是利用结构化的数据库来存储数据，结构化的数据库存储的数据具有高共享、低冗余等特点，然而由于结构化的数据库难以并发查询所以存在查询效率受限的问题。  

检索结果可靠性：目前由于数据挖掘技术以及计算机硬件的限制使得数据处理准确度未能达到理想程度，而且由于一些个人或公司利用搜索引擎现有的漏洞通过作弊手段来干扰检索结果导致检索结果的可靠性可能会有损失。